تشخیص لوپوس اریتماتوز سیستمیک و سایر بیماریهای خود ایمن از قبیل آرتریت روماتوئید، سندرم شوگرن، بیماری مخلوط بافت همبند (MCTD) یا سندرم شارپ، اسکلروز سیستمیک پیشرونده یا اسکلرودرما (PSS)، پلی میوزیت، درماتومیوزیت ، سندرم CREST ( کلسینوز، پدیده رینود، اختلال عملکرد مری، اسکلروداکتیلی، تلانژکتازی)، سیروز و هپاتیت مزمن. نتایج مثبت تست ANA (تیتر 1/160) باید توسط تست ANA Profile پیگیری (Followed up) گردد تا نوع آنتی بادی آن مشخص گردد.